Como les dije... aqui les va la otra forma de colocar filogenias en Google Earth.
2) Importar un archivo de datos (matriz de datos TNT, Winclada, Hennig86)
3) Importar un archivo de árboles *.tre (en notación parentética)
4) Crear una matriz de coordenadas decimales, para vincularla a (1) y (2)
5) Descargar e instalar el modulo Cartographer de Mesquite
6) Crear una vista de los terminales con la información cartográfica de (4)
7) Exportar el árbol a un archivo KML de Google Earth
Y si tenemos una cuenta en Google Maps, quedaría un mapa como:
Ver PAE en un mapa más grande
TNT el mejor programa de parsimonia
TNT el mejor programa de parsimonia
30 de noviembre de 2010
24 de noviembre de 2010
Colocando filogenias en Google Earth (2)
Como les dije, existen otras formas (tal vez más sencillas) de colocar una filogenia en Google Maps.
El siguiente mapa es el resultado de un PAE realizado en áreas protegidas de Venezuela.
La referencia del articulo:
Navarro, J.-C., Liria, J., Piñango, H. Barrera, R. 2007. Biogeographic area relationships in Venezuela: A parsimony analysis of Culicidae-phytotelmata distribution in national parks. Zootaxa 1547: 1-19.
Ver PAE Áreas protegidas de Venezuela en un mapa más grande
Para hacer esto necesitamos:
1) Un conjunto de datos, por ejemplo... una matriz de PAE, en donde se obtuvo un cladograma.
2) Las coordenadas geográficas (lat/long) de los terminales utilizados en (1).
3) Ejecutar Google Earth.
4) Entrar en GeoPhylo. Colocar el árbol en notación parentética y enraizado, y los datos de (2).
5) Generar el archivo Kml, y ver el resultado en Google Earth. Guardar el archivo Kml en el disco rigido.
6) Crear una cuenta en Google Maps, y subir el archivo de (5).
7) Crear el codigo para colocar el mapa en nuestro sitio web.
En la tercera entrega les dire como colocar filogenias de otra forma... un poca más complicada.
El siguiente mapa es el resultado de un PAE realizado en áreas protegidas de Venezuela.
La referencia del articulo:
Navarro, J.-C., Liria, J., Piñango, H. Barrera, R. 2007. Biogeographic area relationships in Venezuela: A parsimony analysis of Culicidae-phytotelmata distribution in national parks. Zootaxa 1547: 1-19.
Ver PAE Áreas protegidas de Venezuela en un mapa más grande
Para hacer esto necesitamos:
1) Un conjunto de datos, por ejemplo... una matriz de PAE, en donde se obtuvo un cladograma.
2) Las coordenadas geográficas (lat/long) de los terminales utilizados en (1).
3) Ejecutar Google Earth.
4) Entrar en GeoPhylo. Colocar el árbol en notación parentética y enraizado, y los datos de (2).
5) Generar el archivo Kml, y ver el resultado en Google Earth. Guardar el archivo Kml en el disco rigido.
6) Crear una cuenta en Google Maps, y subir el archivo de (5).
7) Crear el codigo para colocar el mapa en nuestro sitio web.
En la tercera entrega les dire como colocar filogenias de otra forma... un poca más complicada.
23 de noviembre de 2010
Colocando filogenias en Google Earth
Este video (de aprox. 6 minutos) muestra como pueden colocarse filogenias en Google Earth. Se trata de unificar espacio y tiempo, tal como en su momento fue mencionado por León Croizat. Actualmente a este concepto se le conoce como Geofilogenias (Geophylogenies).
Para realizar una Geofilogenia puede utilizarse la extensión Geophylobuilder para ArcGIS de ESRI. Existen otras opciones como SupraMap; no obstante existen métodos más sencillos para colocar árboles, áreas de endemismo, trazos panbiogeográficos, etc.
Para realizar una Geofilogenia puede utilizarse la extensión Geophylobuilder para ArcGIS de ESRI. Existen otras opciones como SupraMap; no obstante existen métodos más sencillos para colocar árboles, áreas de endemismo, trazos panbiogeográficos, etc.
Ver video en youtube: https://www.youtube.com/watch?v=dnFw5BGJIOk
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