Programa py_tps2tnt

¡Hola a todos los entusiastas de la cladística!

Hoy quiero compartir con ustedes una emocionante herramienta que he desarrollado como parte de una nueva línea de investigación para optimizar las tareas en sus análisis filogenéticos: py_tps2tnt.

py_tps2tnt está diseñado para procesar archivos TPS con coordenadas x,y (con o sin escala), y exportarlos al formato de TNT para análisis filogenéticos vía parsimonia.

Funcionalidades principales de py_tps2tnt:

• Permite transformar archivos TPS que contienen múltiples individuos por taxón.
• Realiza alineamientos mediante Procrustes.
• Calcula promedios de configuración.
• Determina rangos para el tamaño centroide.
• Permite seleccionar distancias interlandmarks.
• Exporta diversos tipos de datos directamente al formato TNT.
• Puede lidiar con archivos TPS que incluyen varios especímenes.
• Calcula el tamaño centroide promedio (en formato de intervalo de confianza o media +/- ES).
• También puede exportar coordenadas promedio o intervalos de distancias interlandmarks (matrices EDMA).
• El usuario puede realizar el análisis generalizado de Procrustes (AGP) a partir de la configuración consenso, la configuración del primer ejemplar, o la configuración deseada.
• Finalmente, el archivo TNT resultante puede incluir el tamaño centroide, configuraciones promedio o alineadas, y matrices de distancia interlandmarks.

Para que puedan ver cómo funciona py_tps2tnt en la práctica, he preparado un tutorial en YouTube (en español):

Les dejo el enlace de github el cual incluye el programa, los requerimientos de instalación (version de Python y librerias), manual en PDF, y datos de ejemplo.

Actualizado 4/7/2025:

Acá podran descargar desde Dropbox el programa ejecutable (no requiere instalar Python + librerías); el archivo *.exe es aprox. 138mb

¡Espero que esta herramienta les sea de gran ayuda en sus investigaciones! Si tienen alguna pregunta o comentario, no duden en dejarlo en la sección de comentarios.