Este método desarrollado por
Eduardo Rapoport se basa en el concepto de distancia con el vecino más próximo
y en la teoría de grafos. El primer paso es el trazado de un árbol de tendido
mínimo (mst, en inglés) entre las localidades o nodos donde se ha
verificado la existencia de la especie. Una vez medidas las distancias, se
halla la media aritmética, y alguna medida de dispersión (varianza, desviación
estándar o error estándar (Rapoport y Monjeau, 2001). El calculo del mst
se realizará utilizando el programa PASSAGE, para lo cual necesitamos un
archivo en formato shapefile (*.shp) como datos de entrada que contenga los biorregistros. En la siguiente
figura se aprecia la vista de el programa PASSAGE:
Oprima con el botón derecho de
ratón sobre la ventana “data monitor”, y aparecerá la opción “load
data”. Seleccione el archivo shapefile:
A continuación, indique el
formato Lat / Lon, y cliqueé en aceptar. Al hacer doble clic en el archivo, se pueden apreciar los datos:
Seleccione el menú “Create”.
Luego oprima en “Distance / Angles for Coordinates”:
Ahora oprima en “Connections
/ Tassellations”, y elija la opción de “Minimum Spanning Tree”:
Para ver el resultado, elija el
menú “Draw”, y seleccione “Draw Points” y “Draw Connections”:
Para guardar los
resultados del mst, oprima botón derecho del ratón sobre el diagrama del
árbol de tendido mínimo, y seleccione “Export to Google Earth”:
|
|||
Utilice el bloc de notas (o Notepad)
para abrir el archivo guardado y verificar su estructura. Note
que PASSAGE almacenó las coordenadas de el mst utilizando comas y no puntos para los decimales:
<?xml version="1.0"
encoding="UTF-8"?>
<kml
xmlns="http://earth.google.com/kml/2.0">
<Document>
<description>PASSaGE 2 GoogleEarth
Export</description>
<name>PASSaGE 2 Export</name>
.
.
.
<coordinates>
-71,4855996555,7,6150988275,0
-69,0809089063,8,8597462197,0
</coordinates>
</LineString>
.
.
.
Si deseamos cargar el árbol de
tendido mínimo en QGIS tenemos dos
posibles soluciones: 1) cambiar
los decimales a puntos utilizando el bloc de notas, o 2) cambiar la configuración de Windows, seleccionar la notación Norteamericana y repetir el análisis en PASSAGE:
.
.
.
<coordinates>
-71.4855996555,7.6150988275,0
-69.0809089063,8.8597462197,0
</coordinates>
</LineString>
.
.
.
Para cargar la capa del mst
en QGIS seleccione en el menú: Capa --> Añadir capa vectorial.
Y a continuación elija el tipo de archivo KML (Keyhole Markup Language). Cambie las propiedades de mst para que pueda verse fácilmente: |
En la última parte de el método
de propincuidad media se deben calcular el promedio y alguna medida de
dispersión (Ej: desviación estándar) para las distancias del mst. Para
ello elegimos la capa de puntos de nuestra especie hipotética y utilizamos la
herramienta del menú: Vectorial --> Herramientas de análisis --> Matriz
de distancia. Luego elegir el tipo de matriz de salida: Matriz de distancia lineal
(N*k x 3). Recuerde que la matriz de distancia posee los decimales en formato
norteamericano, así que debe configurar MS-EXCEL o CALC de OpenOffice para que
lo reconozca:
Ahora la matriz de distancia debe
verse de la siguiente forma. Fíjese que aparece la distancia entre pares de
puntos (InputID -> TargetID), así que solo debemos conocer que distancias se
utilizaron para crear el mst:
InputID
|
TargetID
|
Distance
|
0
|
5
|
1,3124965233
|
0
|
3
|
3,1992492027
|
0
|
2
|
3,4386145291
|
0
|
8
|
4,0752566316
|
0
|
14
|
4,4727581951
|
0
|
13
|
4,7553475788
|
0
|
12
|
4,8508520012
|
0
|
1
|
4,9028601318
|
0
|
4
|
5,1487224861
|
0
|
9
|
5,3137516228
|
0
|
10
|
6,2233965449
|
0
|
6
|
6,3989988376
|
0
|
7
|
6,5732926456
|
0
|
11
|
7,5607337908
|
1
|
12
|
0,3042497689
|
1
|
14
|
1,1610465533
|
1
|
13
|
1,1753958548
|
1
|
11
|
2,7077083909
|
Para realizar esto colocaremos en
QGIS una leyenda sobre los puntos para conocer su ID:
Fíjese que la capa de puntos
muestra el ID de cada biorregistro:
Ahora en la matriz de distancia
calcule los valores promedios y desviación estándar de la conexión (mst).
Por ejemplo, busque la distancia entre 7 y 10, y así sucesivamente:
Según estas distancias, el
promedio es 1,288 grados y desviación estándar 0,869. Realice un buffer
utilizando estos valores para los radios. Una vez finalizado, el resultado de
el método de propincuidad media debería apreciarse como la siguiente figura:
Bibliografía
Rapoport E, Monjeau A. 2001. Aerografía. En: Introducción a la
biogeografía en Latinoamérica: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones.
Llorente J & JJ. Morrone (Eds.). UNAM, México. pp. 23 - 30.
Páginas de Internet:
QGIS Tutorials. Disponible en: http://qgis.spatialthoughts.com
QGIS Documentation. Disponible
en: http://www.qgis.org/en/docs/index.html
