Este método desarrollado por
Eduardo Rapoport se basa en el concepto de distancia con el vecino más próximo
y en la teoría de grafos. El primer paso es el trazado de un árbol de tendido
mínimo (mst, en inglés) entre las localidades o nodos donde se ha
verificado la existencia de la especie. Una vez medidas las distancias, se
halla la media aritmética, y alguna medida de dispersión (varianza, desviación
estándar o error estándar (Rapoport y Monjeau, 2001). El calculo del mst
se realizará utilizando el programa PASSAGE, para lo cual necesitamos un
archivo en formato shapefile (*.shp) como datos de entrada que contenga los biorregistros. En la siguiente
figura se aprecia la vista de el programa PASSAGE:
Oprima con el botón derecho de
ratón sobre la ventana “data monitor”, y aparecerá la opción “load
data”. Seleccione el archivo shapefile:
A continuación, indique el
formato Lat / Lon, y cliqueé en aceptar. Al hacer doble clic en el archivo, se pueden apreciar los datos:
Seleccione el menú “Create”.
Luego oprima en “Distance / Angles for Coordinates”:
Ahora oprima en “Connections
/ Tassellations”, y elija la opción de “Minimum Spanning Tree”:
Para ver el resultado, elija el
menú “Draw”, y seleccione “Draw Points” y “Draw Connections”:
Para guardar los
resultados del mst, oprima botón derecho del ratón sobre el diagrama del
árbol de tendido mínimo, y seleccione “Export to Google Earth”:
|
|||
Utilice el bloc de notas (o Notepad)
para abrir el archivo guardado y verificar su estructura. Note
que PASSAGE almacenó las coordenadas de el mst utilizando comas y no puntos para los decimales:
<?xml version="1.0"
encoding="UTF-8"?>
<kml
xmlns="http://earth.google.com/kml/2.0">
<Document>
<description>PASSaGE 2 GoogleEarth
Export</description>
<name>PASSaGE 2 Export</name>
.
.
.
<coordinates>
-71,4855996555,7,6150988275,0
-69,0809089063,8,8597462197,0
</coordinates>
</LineString>
.
.
.
Si deseamos cargar el árbol de
tendido mínimo en QGIS tenemos dos
posibles soluciones: 1) cambiar
los decimales a puntos utilizando el bloc de notas, o 2) cambiar la configuración de Windows, seleccionar la notación Norteamericana y repetir el análisis en PASSAGE:
.
.
.
<coordinates>
-71.4855996555,7.6150988275,0
-69.0809089063,8.8597462197,0
</coordinates>
</LineString>
.
.
.
Para cargar la capa del mst
en QGIS seleccione en el menú: Capa --> Añadir capa vectorial.
Y a continuación elija el tipo de archivo KML (Keyhole Markup Language). Cambie las propiedades de mst para que pueda verse fácilmente: |
En la última parte de el método
de propincuidad media se deben calcular el promedio y alguna medida de
dispersión (Ej: desviación estándar) para las distancias del mst. Para
ello elegimos la capa de puntos de nuestra especie hipotética y utilizamos la
herramienta del menú: Vectorial --> Herramientas de análisis --> Matriz
de distancia. Luego elegir el tipo de matriz de salida: Matriz de distancia lineal
(N*k x 3). Recuerde que la matriz de distancia posee los decimales en formato
norteamericano, así que debe configurar MS-EXCEL o CALC de OpenOffice para que
lo reconozca:
Ahora la matriz de distancia debe
verse de la siguiente forma. Fíjese que aparece la distancia entre pares de
puntos (InputID -> TargetID), así que solo debemos conocer que distancias se
utilizaron para crear el mst:
InputID
|
TargetID
|
Distance
|
0
|
5
|
1,3124965233
|
0
|
3
|
3,1992492027
|
0
|
2
|
3,4386145291
|
0
|
8
|
4,0752566316
|
0
|
14
|
4,4727581951
|
0
|
13
|
4,7553475788
|
0
|
12
|
4,8508520012
|
0
|
1
|
4,9028601318
|
0
|
4
|
5,1487224861
|
0
|
9
|
5,3137516228
|
0
|
10
|
6,2233965449
|
0
|
6
|
6,3989988376
|
0
|
7
|
6,5732926456
|
0
|
11
|
7,5607337908
|
1
|
12
|
0,3042497689
|
1
|
14
|
1,1610465533
|
1
|
13
|
1,1753958548
|
1
|
11
|
2,7077083909
|
Para realizar esto colocaremos en
QGIS una leyenda sobre los puntos para conocer su ID:
Fíjese que la capa de puntos
muestra el ID de cada biorregistro:
Ahora en la matriz de distancia
calcule los valores promedios y desviación estándar de la conexión (mst).
Por ejemplo, busque la distancia entre 7 y 10, y así sucesivamente:
Según estas distancias, el
promedio es 1,288 grados y desviación estándar 0,869. Realice un buffer
utilizando estos valores para los radios. Una vez finalizado, el resultado de
el método de propincuidad media debería apreciarse como la siguiente figura:
Bibliografía
Rapoport E, Monjeau A. 2001. Aerografía. En: Introducción a la
biogeografía en Latinoamérica: Teorías, conceptos, métodos y aplicaciones.
Llorente J & JJ. Morrone (Eds.). UNAM, México. pp. 23 - 30.
Páginas de Internet:
QGIS Tutorials. Disponible en: http://qgis.spatialthoughts.com
QGIS Documentation. Disponible
en: http://www.qgis.org/en/docs/index.html
Gracias. Muy buen aporte.
ResponderEliminarAlguien me podría rotar el programa Passage..no he podido descargarlo.
ResponderEliminareste es mi correo lf.salazarsalinas@gmail.com
muchas gracias
Hola
ResponderEliminarTe mandé un link de google drive para que lo descargues.
hola muchas gracias, ya pude descargar el programa.
EliminarHola Jonathan, excelente post. Trato de bajar el programa PASSaGE desde su página y aparece un error. Te agradeceré si me puedes indicar otras alternativas para obtenerlo.
ResponderEliminarHola Pablo
EliminarPuedes mandarme tu corrso? escrbe a jonathan.liria@gmail.com
Hola, ¿podrian pasarme la liga de PASSaGE, no he podido descargarlo?.
ResponderEliminarSaludos
Hola Camila
ResponderEliminarAcá esta: https://www.passagesoftware.net/download.php
Llena el formulario, y podrás descargarlo...
Muchas gracias, nuevamente.
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