TNT el mejor programa de parsimonia

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28 de mayo de 2013

Workshop de Biogeografía - Brasil

Del 13 al 18 de junio del año en curso se realizará el I Workshop de Biogeografía, en el Instituto de Biociencias de la USP, Brasil.















Aunque creo es tarde para asistir (según la página, la postulacion era hasta el 30 de abril), aquí les va la información (textual) de el Workshop:

O Workshop tem como missão estimular e impulsionar o desenvolvimento de estudos biogeográficos no meio acadêmico brasileiro, voltado especialmente aos estudantes de pós-graduação. Nossa maior preocupação está em aumentar a produtividade científica do país na área de biogeografia, tanto em qualidade quanto em quantidade. Para tanto, queremos estimular o desenvolvimento de projetos de pesquisa envolvendo questões biogeográficas no Brasil, especialmente para os níveis de Mestrado, Doutorado e Pós-doc.
Grande parte das publicações brasileiras relacionadas com biogeografia são puramente descritivas, tais como, check-lists distribucionais, levantamentos faunísticos e florísticos, mapas de distribuição, entre outras variantes. Poucos artigos analisam e interpretam as distribuições descritas, poucos empregam uma metodologia de análise, poucos relacionam o padrão de distribuição com a história geológica da área. Neste cenário, os pesquisadores brasileiros estão simplesmente provendo dados brutos, que são posteriormente utilizados por outros pesquisadores em suas análises e interpretações mais gerais. Neste cenário, continuamos produzindo artigos de baixo impacto e menor importância, tendo que citar com frequência os artigos de maior relevância produzidos fora do país, artigos estes contendo explicações gerais para os padrões de distribuição e diversificação dos organismos que ocorrem na Mata Atlântica, Amazônia, Cerrado, para a América do Sul e Região Neotropical.
O Workshop de Biogeografia envolverá um grupo de pesquisadores especializados nas mais diversas abordagens da biogeografia. Serão ao todo 10 pesquisadores, sendo oito brasileiros e dois estrangeiros.
A ênfase do Workshop é prover de bases conceituais e ferramental analítico os seus estudantes participantes, para que estes possam desenvolver estudos biogeográficos de cunho teórico ou analítico-interpretativo. Pretendemos criar um ambiente estimulante e ricamente produtivo em termos de idéias e discussões dos métodos de análise.


27 de mayo de 2013

Curso: Introducción a la Morfometría Geométrica 2013

El Postgrado del INECOL invita a el curso: 









 
Introducción a la Morfometría Geométrica

Xalapa, Ver MEXICO

2 de Septiembre al 11 de Octubre, 2013.

Presentación: Este curso esta dirigido a estudiantes de posgrado, pero tambien se invita a estudiantes de licenciatura, profesores e investigadores. El curso contendrá tanto elementos de teoría (justificaciones teóricas y argumentos metodológicos) como prácticas en el uso de programas de computadora para análisis morfométricos, análisis de matrices de deformación y solución de problemas comunes.

Contenido temático:

1. Introducción. Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Métodos de Registro de la forma.

2. Principios de Geometría. Vectores, Espacios geométricos de la forma. Superposición.

3. Análisis morfométricos. Espacios tangentes. Manifolds. Coordenadas Procrustes. TPS generalizado. Variables de deformación. Warps.

4. Análisis estadísticos. Varianza y deformación. Métodos de ordenación PCA, CVA, Regresión. Disparidad.

5. Aplicaciones. Sistemática, Ontogenia, Filogenia, Métodos comparativos, Ecomorfología, Genética cuantitativa.


Convocatoria: La oficina del Posgrado del INECOL publicará la convocatoria para este curso el 15 de Mayo. Después, el Posgrado dispondrá el procedimiento para la inscripción. Los avisos los publicaré en este sitio web del curso.

Contacto
 
Profesor

Dr. Efrain De Luna,
Biodiversidad y Sistemática,
INECOL,
Xalapa, Ver. México
correo electrónico
sitio web

18 de mayo de 2013

Curso Modelado de distribución de especies

Navegando por allí me encontré con estos videos (14 en total) del CONABIO, sobre Modelado de distribución de especies:

Introducción





El resto de los videos los pueden ver aquí


También encontré esta guía sobre Nichos y Áreas de Distribución del CONABIO:

Página interesante sobre Cartografía y SIG

Deseo recomendar esta página:

 
















http://mappinggis.com/

Posee un enlace de Tutoriales, con el siguiente comentario:

"En nuestro afán de difundir el conocimiento y ayudar a todos los interesados en la tecnología geoespacial a mejorar sus aptitudes, hemos recopilado en una única entrada un listado de recursos útiles para todos los que trabajen en el ámbito SIG. Los tutoriales de SIG incluyen libros electrónicos, manuales o cursos relacionados con los SIG. Todos gratuitos."

Mapas base para NDM (9)

Tenía tiempo que no colocaba un mapa base para NDM. Este es uno que siempre quise hacer, y se relaciona el siguiente artículo que lei hace algunos años...

Biogeographic relationships of the Galapagos terrestrial biota: parsimony analyses of endemicity based on reptiles, land birds and Scalesia land plants. 2001. Journal of Biogeography

Un poco de información sobre el artículo:

Location

The Galapagos archipelago is located 1000 km off the western coast of Ecuador. It is formed by 13 large islands (greater than 10 km2), six smaller islands and over 40 islets that have official names. Other small rocks and islets remain unnamed. The archipelago straddles the equator at the 90th meridian west.

Methods

Lists of the living reptilian, land bird species and genera and Scalesia land plant species were compiled from various published and online works. Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) was used to find the most parsimonious cladograms depicting the biogeographic relationships of Galapagos to the American continents and the intra-archipelago ones. Analyses of species richness vs. island extents, species sharing vs. distance between islands, and species sharing vs. island extents were performed to assess the distribution patterns of the analysed vertebrates.

Results

Genus distribution-based PAE results suggest that Galapagos archipelago was settled by South American reptiles. The Galapagos islands cluster with Ecuador, Chile and Peru. A large American clade including Meso-America, USA, Mexico and Colombia is supported by this work too. Sister group relationships between the Galapagos–western South American clade and the large American clade are not defined. Species distribution-based PAE results are not able to place the Galapagos into any clade. PAE intra-archipelago output shows that large islands cluster together, very small islands are placed with lesser confidence because of ecological noise explained by the analyses of species richness vs. extent, shared species vs. distance between islands, and shared species vs. extent relationships. This distribution-based work supports previously published phylogeny-based biogeographic analyses and corroborates them with an independent evidence. Two competing colonization models of the archipelago are discussed.


Esta es la imagen para los mapas base:






















Aquí esta el enlace para el archivo XYD, y como siempre en formato shapefile (SHP).