Programa py_tps2tnt

Tenía tiempo en realizar una entrada.

En esta oportunidad les comento sobre una nueva línea de investigación que estoy desarrollando.

Muchos colegas me habían comentado sobre Python y su potencialidad.

Decidí adentrarme en lo más básico de la programación en Python, y desarrollar pequeños programas para apoyar en tareas que tradicionalmente consumen tiempo.

Les presento py_tps2tnt

Este programa permite procesar archivos TPS con coordenadas x,y (con escala o no), y exportarlos al formato de TNT para analisis filogenéticos via parsimonia; py_tps2tnt puede lidiar con archivos TPS que incluyen varios especímenes, y calcular el tamaño centroide promedio (en formato de intervalo de confianza o media +/- ES), coordenadas promedio, o inclusive intervalos de distancias interlandmarks (matrices EDMA). También el usuario puede realizar el análisis generalizado de Procrustes a partir de la configuración consenso, la configuración del primer ejemplar, o la configuración deseada.

Finalmente, el archivo TNT puede incluir el tamaño centroide, configuraciones promedio o alineadas, y matrices de distancia interlandmarks. 

La cita sugerida es:

Liria, J. (2024) py_tps2tnt v4.2: A program to export geometric morphometrics (x,y coordinates) to TNT format for cladistic analysis of continuous data. https://doi.org/10.5281/zenodo.14046448

Les dejo el enlace de github el cual incluye el programa, los requerimientos de instalación (version de Python y librerias), manual en PDF, y datos de ejemplo.

De igual forma preparé un tutorial en youtube (en español):