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TNT el mejor programa de parsimonia

sábado, 18 de mayo de 2013

Curso Modelado de distribución de especies

Navegando por allí me encontré con estos videos (14 en total) del CONABIO, sobre Modelado de distribución de especies:

Introducción





El resto de los videos los pueden ver aquí


También encontré esta guía sobre Nichos y Áreas de Distribución del CONABIO:

Página interesante sobre Cartografía y SIG

Deseo recomendar esta página:

 
















http://mappinggis.com/

Posee un enlace de Tutoriales, con el siguiente comentario:

"En nuestro afán de difundir el conocimiento y ayudar a todos los interesados en la tecnología geoespacial a mejorar sus aptitudes, hemos recopilado en una única entrada un listado de recursos útiles para todos los que trabajen en el ámbito SIG. Los tutoriales de SIG incluyen libros electrónicos, manuales o cursos relacionados con los SIG. Todos gratuitos."

Mapas base para NDM (9)

Tenía tiempo que no colocaba un mapa base para NDM. Este es uno que siempre quise hacer, y se relaciona el siguiente artículo que lei hace algunos años...

Biogeographic relationships of the Galapagos terrestrial biota: parsimony analyses of endemicity based on reptiles, land birds and Scalesia land plants. 2001. Journal of Biogeography

Un poco de información sobre el artículo:

Location

The Galapagos archipelago is located 1000 km off the western coast of Ecuador. It is formed by 13 large islands (greater than 10 km2), six smaller islands and over 40 islets that have official names. Other small rocks and islets remain unnamed. The archipelago straddles the equator at the 90th meridian west.

Methods

Lists of the living reptilian, land bird species and genera and Scalesia land plant species were compiled from various published and online works. Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) was used to find the most parsimonious cladograms depicting the biogeographic relationships of Galapagos to the American continents and the intra-archipelago ones. Analyses of species richness vs. island extents, species sharing vs. distance between islands, and species sharing vs. island extents were performed to assess the distribution patterns of the analysed vertebrates.

Results

Genus distribution-based PAE results suggest that Galapagos archipelago was settled by South American reptiles. The Galapagos islands cluster with Ecuador, Chile and Peru. A large American clade including Meso-America, USA, Mexico and Colombia is supported by this work too. Sister group relationships between the Galapagos–western South American clade and the large American clade are not defined. Species distribution-based PAE results are not able to place the Galapagos into any clade. PAE intra-archipelago output shows that large islands cluster together, very small islands are placed with lesser confidence because of ecological noise explained by the analyses of species richness vs. extent, shared species vs. distance between islands, and shared species vs. extent relationships. This distribution-based work supports previously published phylogeny-based biogeographic analyses and corroborates them with an independent evidence. Two competing colonization models of the archipelago are discussed.


Esta es la imagen para los mapas base:






















Aquí esta el enlace para el archivo XYD, y como siempre en formato shapefile (SHP).

miércoles, 20 de marzo de 2013

Curso programas de computación para Biogeografía (NDM y VIP)

CURSO DE POSTGRADO TEÓRICO - PRÁCTICO INTRODUCTORIO

"PROGRAMAS DE COMPUTACIÓN PARA BIOGEOGRAFÍA: FUNDAMENTOS Y APLICACIONES"

DOCENTES RESPONSABLES:

Dra.  M.  Dolores  CASAGRANDA  (Inst.  Herpetología-FML  - Postdoc Carnegie Museum)

Dra. Claudia A. SZUMIK  (INSUE; Fac. Cs. Naturales e  IML  - Inv. Indep. CONICET)

Coordinador:  Dr.  Diego  BALDO.  Laboratorio  de  Genética Evolutiva, Instituto de Biología Subtropical (CONICET-UNaM).

Objetivos del curso:

Brindar a los alumnos fundamentos teóricos y metodológicos de ayuden a abordar algunas preguntas y problemas  de  la  biogeografía  histórica;  específicamente  en  el  análisis  de  áreas  de  endemismo  y eventos de vicarianza. Se propone dar a los alumnos herramientas básicas necesarias para desarrollar estudios biogeográficos básicos. De manera que  los objetivos de este  curso no  son  sólo mostrar  los fundamentos  teóricos  sino  también  su  aplicación  práctica  mediante  el  uso  de  programas  de computación específicamente desarrollados para estos estudios.

Contenidos:

Tema 1. AREAS DE ENDEMISMO. Generalidades. Propuestas  formales y no  tan  formales para  la identificación  de  áreas  de  endemismo.  Areas  de  endemismo  y  regionalizaciones  biogeográficas Importancia de los métodos cuantitativos y su relación con lo que se pretende evaluar. Introducción a los programas NDM/VNDM parte I.

Tema  2.  AREAS  DE  ENDEMISMO.  Criterio  de  optimalidad  en  el  análisis  de  endemicidad. Propuestas de renombrar el concepto de a.e. Necesidad de modelo nulo?. Introducción a los programas NDM/VNDM parte II.

Tema 3. EVENTOS DE VICARIANZA. Distinción entre estudios sobre historia de la tierra e historia de los taxones. Críticas y propuestas de Hovenkamp sobre la Biogeografía Histórica. Importancia del componente  espacial.  Criterio  de  optimalidad  para  la  identificación  de  potenciales  barreras. Introducción al programa VIP.

Información:

Secretaría del Doctorado en Ciencias Aplicada, Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales.

Calle Félix de Azara 1552 – 1º Piso (3300) Posadas – MisionesTE: 0376-422186 Int. 125 (Martes a Viernes de 16:00 a 18:00 hs.) Email: doctoradoaplicadas@fceqyn.unam.edu.ar/@gmail.com

Creado Grupo Google de discusión Biogeografía

Recientemente fue creado un grupo de discusión llamado:
 
GRUPO LATINOAMERICANO Y CARIBEÑO DE BIOGEOGRAFÍA

El “Grupo Latinoamericano y Caribeño de Biogeografía” pretende promover el desarrollo y consolidación de una comunidad biogeográfica diversa. Está abierto a la participación de biogeógrafos, ya sean profesores, investigadores, estudiante o aficionados.

https://groups.google.com/d/forum/biogeo-la

Te invitamos a participar, pero antes las reglas para realizar los comentarios:

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miércoles, 13 de marzo de 2013

Curso Introducción a la teoría y práctica de la metodología cladística

Esta información fue colocada en el Grupo Clado de Yahoo:


Los invitamos a participar del Curso Introducción a la teoría y práctica de la metodología cladística, organizado por el PROBIOL (Programa de Posgrado en Biología), Mendoza.

El evento tendrá lugar los días 13 al 17 de Mayo del 2013 en el CCT-CONICET Mendoza.



Este curso está destinado a estudiantes avanzados de carreras de Ciencias Naturales y estudiantes de doctorado que planean utilizar la metodología Cladística en sus proyectos de tesis.

Aquí tienen el PDF de el curso.

Para mayor información contactar a PROBIOL: Informes e inscripción para los cursos: María Eugenia Pozzatto (probiol@fca.uncu.edu.ar; 0261-413-5000, int. 1123).