TNT el mejor programa de parsimonia

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7 de noviembre de 2023

Una geofilogenia para 10 años de la RACB 1997-2007

La Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía (RACB), es un evento que se organiza en este país con la finalidad de agrupar a distint@s investigador@s y estudiantes (pre- y posgrado) que realizan investigaciones en analisis filogenéticos y estudios sobre la distribución de la biota. 

Durante la conmemoración de los 10 año de RACB, 1997-2007 tuve la oportunidad de recibir la siguiente imagen preparada por los organizadores:


Como se puede apreciar, es un cladograma con un arreglo de ramas por periodos (años), donde se indican las distintas RACB y sus sedes, desde Tucumán en 1997, pasando por Buenos Aires 1999, Mendoza 2001, Córdoba 2003, Salta 2004, Trelew 2006, y San Isidro en 2007.

Se me ocurrió una forma de homenajear a todos los organizadores de esos 10 años, y también a los participantes.

Realicé una geofilogenia en Mesquite a partir de las localidades de cada RACB; por ejemplo, Instituto Miguel Lillo en 1997, Museo Paleontológico Egidio Feruglio en 2006, Instituto de Botánica Darwinion en 2007, entre otras.  

Acá les presento algunos mapas,

  y la vista en Google Earth con el archivo kml:

 Vista general de la geofilogenia.

 Detalle con imagen (logo) de cada RACB.

16 de junio de 2020

Reunión de Sistemática, Biogeografía y Evolución (updated)


En estos tiempos de aislamiento social y restricciones de movilidad, producto de la pandemia por COVID19 (acá una aplicación web sobre el estatus de la pandemia), muchos de nosotros esperamos encontrarnos con eventos de este tipo.

Se trata de la I Reunión de Sistemática, Biogeografía y Evolución, la cual pretende llegar a las personas con restricciones económicas para asistir a reuniones científicas con intereses en tópicos de la biología evolutiva.

La inscripción es muy sencilla...ingresa acá

El evento tendrá lugar los días 28, 29 y 30 de julio a través de sesiones de Zoom. El idioma de las charlas es elegible por los hablantes (del inglés, español o portugués). Pero las diapositivas / presentaciones y multimedia deben estar en inglés.

El evento se divide en seis simposios que cubren una amplia variedad de disciplinas. Cada simposio tendrá un orador principal y cuatro charlas.

Gracias totales... J. Grosso, A. Adruchow-Colombo, J. S Arias, A. Torres, y demás organizadores.

SBEmeeting



Actualización al 30-7-2020:

Así quedaron las ponencias y sesiones de posters:


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Y acá la foto de parte del grupo que asistimos,... pero les digo,...había más de 1000 participantes:




1 de diciembre de 2018

XIII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía (RACB) - Resúmenes

Hola a tod@s

Les traigo información reciente relacionada con la XIII-RACB.



Acá tienen las direcciones donde podrán ver todo lo relacionado a la presentación (formato) y envió de resúmenes: 

Fecha límite envío de resúmenes: 22 de Febrero 2019.

Para revisar el formato de los resúmenes ir al siguiente enlace: Formato de resúmenes

Para enviar un resumen ir al siguiente enlace: Envío de resúmenes online



Finalmente les dejo el vínculo de la 2da circular

2 de septiembre de 2018

XIII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía (RACB)

Estimad@s amigos


Esperamos mucho tiempo, pero ya tenemos fecha de la próxima Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía (RACB)!

El evento se desarrollará en la ciudad de San Miguel de Tucumán del 8 al 10 de abril del 2019. La XIII RACB es auspiciada por la Unidad Ejecutora Lillo - CONICET, Fundación Miguel Lillo:




Preparen sus ponencias! Nos vemos en Tucumán...

Acá les comparto el pdf con la primera circular.




2 de abril de 2017

I Congreso Latinoamericano de Biogeografía

La Universidad Regional Amazónica IKIAM será la anfitriona del I Congreso Latinoamaricano de Biogeografía. Este evento se realizará del 19-24 noviembre de 2017 en el Campus de IKIAM, 7 Km vía Muyuna, Napo - Ecuador.

Más información en la página oficial: I Congreso Latinoamaricano de Biogeografía

Correo eletrónico: congreso.biogeografia@ikiam.edu.ec


 


10 de mayo de 2016

Charla sobre cuantificación del fenotipo mediante morfometría geométrica


Acá les muestro la charla que tuve en la Universidad Regional Amazónica IKIAM:





Los humanos en su afán de organizar y clasificar la diversidad biológica, han venido tratando de utilizar formas eficientes para describir la diversidad fenotípica de los organismos. La morfometría geométrica se presenta como una herramienta que cuantifica estas variaciones en dos componentes: conformación y tamaño. En esta charla se mostrarán algunas aplicaciones de la morfometría en distintos grupos de animales.

21 de mayo de 2012

Megafilogenias: ¿Quién y cómo lo hicieron?

¿Existe un record para la filogenia de mayores dimensiones posible?

Imaginen el Record Mundial Guinnes para la filogenia que contemple el mayor número de taxa posibles (Megafilogenia):














Ya existe un record:

Goloboff, P.A., Catalano, S.A., Mirande, J.M., Szumik, C.A., Arias, J.S., Kallersjo, M., Farris, J.S., 2009. Phylogenetic analysis of 73 060 taxa corroborates major eukaryotic groups. Cladistics 25, 211– 230.



















Esto no implica que hasta el 2009 no se realizaran megafilogenias. Sin  embargo, este es el estudio de mayores dimensiones (taxa y caracteres) conocido hasta el momento. 

Recientemente, Goloboff y Catalano (2012) publicaron un articulo donde se explica como puede prepararse una matriz de tales dimensiones:

              Este es el manual de GB-to-TnT: GB2TNT_MANUAL.pdf 
View more documents from jliria

El año pasado, tuvimos la visita del Dr. Pablo Goloboff, durante el Congreso Venezolano de Entomología. En su Charla nos mostró algunos de los avances que permitieron realizar esta Megafilogenia. Aquí les dejo la presentación:




9 de febrero de 2012

X REUNIÓN ARGENTINA DE CLADÍSTICA Y BIOGEOGRAFÍA

Este año se realizará la X REUNIÓN ARGENTINA DE CLADÍSTICA Y BIOGEOGRAFÍA en la ciudad de Mendoza - Argentina, durante los días 29 al 31 de mayo. El evento es organizado por el Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas.

Aquí les coloco la circular en PDF:

10 de julio de 2010

Conferencias de Farris, Goloboff y Janies

Para ver las Conferencias es necesario instalar Real Player




Current Topics Workshop: The Problems of Phylogenetic Analysis of Large Datasets: Abstracts and Lectures

In this workshop, we will focus on recent advances in phylogenetic analysis of large datasets considering two major aspects. The first is the problem of analysis of datasets with a large number of taxa (exceeding several hundreds). This includes recent improvements in tree search algorithms and synergistic application of parallelization strategies using Beowulf clusters and distributed computing. The workshop participants will also compare and discuss the use of improved search tools for competing methods (e.g., parsimony, maximum likelihood, Bayesian). This discussion will illustrate advantages and problems associated specific to various methods with the analysis of datasets with large number of taxa.

The second point of discussion will be the problems associated with analysis of large comparative genomic datasets with various types of information (homology, rearrangement, origin, loss, and multiplication among loci between ancestor and descendant genomes). This problem includes the generalization of edit cost models to account for of multiple kinds of genomic change rather than only DNA substitution.

In summary, this workshop aims to gather leading researchers in this field to discuss common and specific problems, applications, and new models for large-scale phylogenetic and genomic analysis.

LECTURE MATERIALS:

J. Farris, Molecular Systematics Laboratory, Swedish Museum of Natural History.

Intro

Pablo A. Goloboff, Instituto Superior de Entomologia, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas, Miguel Lillo 205, 4000 San Miguel de Tucuman, Argentina.

On divide and conquer strategies for parsimony analysis of large data sets

Daniel Janies, Department of Biomedical Informatics, The Ohio State University

Applications of large-scale phylogenetic analysis for research in emerging infectious disease