Taller intensivo Morfometría Geométrica 2018

Hola a tod@s

A continuación se remiten fotografías del Taller Morfometría Geométrica dictado del 2 al 6 de julio en la Facultad de Cs. Biológicas de la Universidad Central del Ecuador (UCE). Esta capacitación se realizó en el marco del V Ciclo de Conferencias en Investigación Biológica (ver entrada pasada con la información).

Entre los cursantes tuvimos estudiantes de Biología UCE (6to, 7mo, 8vo y 9no semestres), así como estudiantes y egresados de otras instituciones: Universidad de Azuay, Universidad de las Américas, y Universidad San Francisco de Quito. 

 

 

El V Ciclo de Conferencias en Investigación Biológica de la Facultad de Ciencias Biológicas – Universidad Central del Ecuador, tiene el agrado de invitar al:

Taller PRINCIPIOS EN MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA:

El taller es teórico-prácticos y se dictará en las tardes de los 5 días del Ciclo de Conferencias; en aulas y laboratorios adecuados.

A cada persona que participe tanto en las charlas como en alguno de los talleres, se le otorgará un certificado de capacitación o aprobación (depende del taller) de 40 horas.

Los costos para la inscripción (antes del 30 de junio) son:
          GRATIS para estudiantes UCE
          20$ para estudiantes externos y graduados Biología UCE
          30$ para profesionales

Para quienes paguen después del 30 de junio:
         GRATIS para estudiantes UCE
         25$ para estudiantes externos y graduados Biología UCE
         40$ para profesionales

El precio incluye la participación en uno de los talleres y el certificado.

Charla sobre cuantificación del fenotipo mediante morfometría geométrica

Acá les muestro la charla que tuve en la Universidad Regional Amazónica IKIAM:

Los humanos en su afán de organizar y clasificar la diversidad biológica, han venido tratando de utilizar formas eficientes para describir la diversidad fenotípica de los organismos. La morfometría geométrica se presenta como una herramienta que cuantifica estas variaciones en dos componentes: conformación y tamaño. En esta charla se mostrarán algunas aplicaciones de la morfometría en distintos grupos de animales.

Curso de Morfometría Geométrica en Quito 2016

En esta entrada les traigo fotos de un nuevo curso de Morfometría Geométrica en Ecuador. Este se realizó en la Universidad de las Fuerzas Armadas (ESPE). Contó con la participación de Investigadores y estudiantes de ESPE, profesionales de la Universidad Regional Amazónica IKIAM, así como profesionales de AGROCALIDAD.

Curso de Postgrado: Morfometría Geométrica para Biólogos y ciencias afines

CURSO DE POSTGRADO

 23 AL 27 DE FEBRERO DE 2015

Morfometría geométrica para biólogos y ciencias afines

Profesor: Dr. Jonathan Liria Salazar (Coordinador). Laboratorio Museo de Zoología, Facyt. Universidad de Carabobo. Email: jonathan.liria@gmail.com

Teoría:

Tema 1. Historia de la morfometría.

Tema 2. Fundamentos en Morfometría Geométrica
Tema 3. Adquisición de datos (registro de imágenes)
Tema 4. Tipos de datos (puntos anatómicos de referencia)
Tema 5. Métodos de Superposición
Tema 6. Programas computacionales para Morfometría Geométrica
Tema 7. Métodos de Deformación
Tema 8. Análisis Estadísticos univariados (paramétricos y no-paramétricos)
Tema 9. Análisis estadísticos multivariados
Tema 10. Análisis de Matriz de Distancia Euclideana
Tema 11. Análisis filogenéticos a partir de configuraciones de puntos anatómicos de referencia

Sesiones  practicas:

Practica 1. Adquisición y procesamiento de imágenes.

Practica 2. Digitalización de puntos anatómicos de referencia.
Practica 3. Análisis morfométrico I.
Practica 4. Análisis morfométrico II.

Programas informáticos:

Serie TPS: http://life.bio.sunysb.edu/morph/index.html

Paquete IMP: http://www3.canisius.edu/~sheets/moremorph.html

PAST: http://folk.uio.no/ohammer/past/download.html

TNT: http://www.zmuc.dk/public/phylogeny

Duración: 1 semana intensiva (Teórico Práctico), 40 horas

Acreditación: 2 UC para estudiantes de postgrado

Cupo Máximo (15 estudiantes)

Dirigido a: Profesionales en Biología y carreras afines

Notificar su participación a: POSTGRADO EN ECOLOGIA , Telf. 0212-6051300

Contacto e Información: herminia.daboin@ciens.ucv.ve

Organizadora: elizabeth.gordon@ciens.ucv.ve; egordoncolon@gmail.com 

COORDINADORA DEL POSTGTADO EN ECOOLOGIA: Dra. Estrella Villamizar

Correo:  estrella.villamizar@ciens.ucv.ve; estrellavillamizar@yahoo.com

Curso: Introducción a la Morfometría Geométrica 2013

El Postgrado del INECOL invita a el curso: 

 
Introducción a la Morfometría Geométrica

Xalapa, Ver MEXICO

2 de Septiembre al 11 de Octubre, 2013.

Presentación: Este curso esta dirigido a estudiantes de posgrado, pero tambien se invita a estudiantes de licenciatura, profesores e investigadores. El curso contendrá tanto elementos de teoría (justificaciones teóricas y argumentos metodológicos) como prácticas en el uso de programas de computadora para análisis morfométricos, análisis de matrices de deformación y solución de problemas comunes.

Contenido temático:

1. Introducción. Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Métodos de Registro de la forma.

2. Principios de Geometría. Vectores, Espacios geométricos de la forma. Superposición.

3. Análisis morfométricos. Espacios tangentes. Manifolds. Coordenadas Procrustes. TPS generalizado. Variables de deformación. Warps.

4. Análisis estadísticos. Varianza y deformación. Métodos de ordenación PCA, CVA, Regresión. Disparidad.

5. Aplicaciones. Sistemática, Ontogenia, Filogenia, Métodos comparativos, Ecomorfología, Genética cuantitativa.


Convocatoria: La oficina del Posgrado del INECOL publicará la convocatoria para este curso el 15 de Mayo. Después, el Posgrado dispondrá el procedimiento para la inscripción. Los avisos los publicaré en este sitio web del curso.

Contacto
 
Profesor

Dr. Efrain De Luna,
Biodiversidad y Sistemática,
INECOL,
Xalapa, Ver. México
correo electrónico
sitio web

Configuraciones nodo-x-nodo

Hola:

Acá les coloco una animación realizada con GIFAnimator.

Esta animación se realizó utilizando, uno de los dos árboles más parsimoniosos obtenidos con la matriz de Soto-Vivas et al. (2011)* en TNT. Luego se preparó una matriz de Puntos Anatómicos de Referencia o landmarks, para mapaear las configuraciones de los PAR. Seguidamente se empleó el macro de TNT export_tps.run para exportar las configuraciones hipotéticas de los nodos, y las configuraciones de los terminales (Taxa). Finalmente este archivo TPS se abrió en PAST para utilizar la opción thin-plate spline y graficar las deformaciones entre los nodos seleccionados.

(*) SOTO-VIVAS, Ana, LIRIA, Jonathan, & LUNA, Efraín de. (2011). Morfometría geométrica y filogenia en Rhodniini (Hemiptera, Reduviidae) de Venezuela. Acta zoológica mexicana, 27(1), 87-102.