TNT el mejor programa de parsimonia

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21 de abril de 2014

Colocando filogenias en Google Earth (4)



Esta entrada retoma los antiguos post donde les mostraba como colocar filogenias en Google Earth (GE), para crear “geofilogenias”.

En esta ocasión les muestro la aplicación desarrollada por R. Page:




Para crear un archivo kml que podamos ver en GE necesitamos:

Un archivo de árboles en formato NEXUS, y un listado de terminales con coordenadas geográficas. Ambos deben coincidir los nombres de los terminales:


 

Ejecutamos la aplicación de IPHYLO, e insertamos el archivo de árboles (pendientes con el formato, porque el comando UTREE no es reconocido):




Luego colocamos el listado de terminales y coordenadas (en grados decimales); fíjense que la primera fila contiene el título de cada columna (Scientific_name,Latitude,Longitude):



 
Finalmente nos muestra si los datos hacen “match”, y más abajo aparece el código kml (que puede ser copiado y guardado):


 

El archivo kml puede abrirse con GE:


Fíjense que este árbol está anclado al suelo y las ramas se ven muy extendidas.

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