TNT el mejor programa de parsimonia

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24 de abril de 2011

Feliz cumple Willi Hennig!

El 20 de Abril.... cumplió años Willi Hennig! Aca les dejo un artículo publicado el año pasado en el suplemento de la revista PALAEODIVERSITY:


3 de abril de 2011

Morfometría y Filogenia (2)

Hace unos días, Santiago Catalano me envió un programa para MS-DOS, el cual permite pasar archivos TPS al formato de TnT:















Catalano es el autor (junto a Goloboff y Giannini) de los artículos:

Catalano S., Goloboff P. A. & N. Giannini. 2010. Phylogenetic morphometrics (I): the use of landmark data in a phylogenetic framework. Cladistics, 26: 11-20.


Goloboff P. A. & S.A. Catalano.  2010. Phylogenetic morphometrics  (II):  algorithms  for  landmark optimization. Cladistics, 26: 1-10.

A continuación les dejo un pequeño video para mostrarles como usar el programa; tambien les dejo el link para que descarguen TPS2TNT (este programa no ha sido probado con varios set de datos... asi que debemos verificar si hay errores):

27 de marzo de 2011

Mapas base para NDM (2)

Aquí les dejo otros mapas para usarlos con NDM:

Mexico














España













España (Islas Canarias)


Estados Unidos












Y este es el vínculo para la carpeta con las capas (shapefiles) de los mapas base

Si necesitan otro pais... pueden contactarme.

26 de marzo de 2011

Mapas base para NDM

En esta oportunidad les traigo mapas base para utilizarlos como "map line" en el programa NDM. Aquí les dejo los links (en Box.net), donde tengo los archivos xyd:





























































Les remito la informacion que aparece en el manual de NDM (Szumik et al. 2006: 9)

"En este tipo de matrices VNDM permite poner de fondo los límites de un mapa. Esto se logra incluyendo al final del archivo:

map
line
66.217 21.767
66.183 21.783
66.167 21.800
66.117 21.817
66.067 21.833
66.050 21.850
66.050 21.867
66.050 21.883

Cada línea (máximo 300 líneas) del mapa puede tener hasta 5000 referencias planas. Nótese que si se termina de definir la península de Yucatán y se pasa a la costa occidental de México debe definirse una nueva línea, sino ese salto aparecerá dibujado también en el mapa. También es posible editar las líneas en modo gráfico y salvar posteriormente las coordenadas resultantes".

Un ejemplo de estos mapas base.. lo tienen en la siguiente figura:

Tomada de:

CASAGRANDA M , DOLORES; ROIG-JUNENT, SERGIO and SZUMIK, CLAUDIA . Endemismo a diferentes escalas espaciales: un ejemplo con Carabidae (Coleóptera: Insecta) de América del Sur austral. Rev. chil. hist. nat. 2009, vol.82, n.1, pp. 17-42 .

14 de marzo de 2011

MartiTracks en linux

Hace unos dias, un amigo colocó en su blog los pasos para correr Martitracks en linux:

aqui les dejo el enlace: Biogeografía y Martitracks

Para los que no lo conocen... Martitracks es un nuevo programa para realizar trazos individuales y generalizados:



imagen tomada de http://axiompanbiog.com/martigtrack.aspx