Áreas de Endemismo de Venezuela

Esta entrada fue inspirada en este trabajo:

Szumik et al. 2011. Detecting areas of endeminm with a taxonomically diverse data set: plants, mammals, reptiles, amphibians, birds, and insects from Argentina. Cladistics 1-13.

En Venezuela existen varias propuestas de áreas de Endemismo, sin embargo en cada caso han sido postuladas para grupos particulares: Peces, Reptiles, Mamíferos o Insectos. Por ello, el presente estudio (preliminar) pretende realizar un análisis con datos de diversos grupos taxonómicos.

La matriz realizada contempla 8964 bioregistros y 1292 especies de: Anfibios, Reptiles, Mamíferos, Aves e Insectos:

 En NDM, se utilizó la opción AUTO para construir cuadriculas de 0,58° x 0,58°; también fue considerado el relleno especial. Posteriormente se generó la matriz:

Para este tamaño de cuadriculas, se obtuvieron 194 áreas. Aquí les muestro algunas de ellas:

En este caso se presenta el Consenso a partir del 70% de similaridad de especies que integran el área.

En lineas generales, existen áreas con elevados índices de endemicidad: Andes y Cordillera Central de La Costa. Un análisis posterior con cuadriculas más pequeñas reveló áreas de endemismo similares, pero con mayor índice de endemicidad para las áreas al Sur del país. 

En una próxima entrada tratare de disponer de bioregistros de grupos de plantas.

Megafilogenias: ¿Quién y cómo lo hicieron?

¿Existe un record para la filogenia de mayores dimensiones posible?

Imaginen el Record Mundial Guinnes para la filogenia que contemple el mayor número de taxa posibles (Megafilogenia):

Ya existe un record:

Goloboff, P.A., Catalano, S.A., Mirande, J.M., Szumik, C.A., Arias, J.S., Kallersjo, M., Farris, J.S., 2009. Phylogenetic analysis of 73 060 taxa corroborates major eukaryotic groups. Cladistics 25, 211– 230.

Esto no implica que hasta el 2009 no se realizaran megafilogenias. Sin  embargo, este es el estudio de mayores dimensiones (taxa y caracteres) conocido hasta el momento. 

Recientemente, Goloboff y Catalano (2012) publicaron un articulo donde se explica como puede prepararse una matriz de tales dimensiones:

              Este es el manual de GB-to-TnT: GB2TNT_MANUAL.pdf 

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El año pasado, tuvimos la visita del Dr. Pablo Goloboff, durante el Congreso Venezolano de Entomología. En su Charla nos mostró algunos de los avances que permitieron realizar esta Megafilogenia. Aquí les dejo la presentación:

Venezuela_2011.ppt

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Mapas base para NDM (8)

Esta entrada contempla un mapa base del Neártico y Neotrópico. Es uno de los primeros que hice... pero hasta el momento no lo había colocado en el blog.

Este es el vínculo para el archivo XYD.

Espero les sirva!

Mapas base para NDM (7)

Esta entrada contiene el mapa base (map line) para NDM del Continente Africano

Formato xyd (xyData)

Formato shp (Shapefile)


Les recuerdo (tomado del Manual de NDM) en que consiste el comando "map line":

"En este tipo de matrices VNDM permite poner de fondo los límites de un mapa. Esto se logra incluyendo al final del archivo:   

                                      map 
                                      line 
                                      66.217 21.767
                                      66.183 21.783
                                      66.167 21.800
                                      66.117 21.817
                                      66.067 21.833
                                      66.050 21.850
                                      66.050 21.867
                                      66.050 21.883

Cada línea (máximo 300 líneas) del mapa puede tener  hasta 5000 referencias planas. Nótese que si se termina de definir la península de Yucatán y se pasa a la costa occidental de México debe definirse una nueva línea, sino ese salto aparecerá dibujado también en el mapa. También es posible editar las líneas en modo gráfico y salvar posteriormente las coordenadas resultantes."

Ahora que el mapa base esta disponible, sería interesante realizar un analisis de endemismo con NDM para el Continente Africano. Asi podrían compararse los resultados con otros estudios.

Modelo de Nicho y especies amenazadas

Encontré un articulo interesante sobre el uso de los modelos de distribución y su aplicación en el monitoreo de especies amenazadas. En este caso se utilizó MaxEnt para predecir la distribución potencial de Astragalus oxyglottis.

Los modelos de distribución en el trabajo de campo: localización de nuevas poblaciones de especies amenazadas

Tambien si desean profundizar más sobre el estudio de caso para esta especie, consulten:

Informe de resultados de Astragalus oxyglottis

Libro "Manual of Phytogeography"

Aqui les dejo este clásico:

Léon_Croizat-Manual_of_Phytogeography__An_Account_of_Plant-Dispersal_Throughout_the_World__-Uitgeverij_Dr._W._Junk(1952).djvu

Esta en formato djvu. Si no poseen un visor para este tipo de archivos, esta es una buena opción:

http://djvu.sourceforge.net/